Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
NFX1Q12986 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NFX1Q12986 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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