Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TROQ12816 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TROQ12816 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TROQ12816 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TROQ12816 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TROQ12816 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TROQ12816 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TROQ12816 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TROQ12816 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TROQ12816 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TROQ12816 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TROQ12816 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TROQ12816 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TROQ12816 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TROQ12816 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TROQ12816 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
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