Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SREBF2Q12772 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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