Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLEQ07864 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLEQ07864 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms