Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms