Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERCC6Q03468 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ERCC6Q03468 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms