Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLCB3Q01970 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms