Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRCDQ00LT1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRCDQ00LT1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms