Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BEX3Q00994 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BEX3Q00994 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms