Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMO4P61968 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LMO4P61968 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMO4P61968 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMO4P61968 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms