Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNA2P51530 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNA2P51530 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNA2P51530 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNA2P51530 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNA2P51530 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNA2P51530 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNA2P51530 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNA2P51530 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNA2P51530 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms