Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms