Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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CENPFP49454 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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CENPFP49454 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPFP49454 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPFP49454 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPFP49454 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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CENPFP49454 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPFP49454 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPFP49454 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPFP49454 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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CENPFP49454 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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CENPFP49454 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPFP49454 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPFP49454 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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CENPFP49454 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPFP49454 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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