Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NESP48681 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NESP48681 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NESP48681 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NESP48681 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NESP48681 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NESP48681 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
NESP48681 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NESP48681 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NESP48681 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NESP48681 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
NESP48681 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NESP48681 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NESP48681 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NESP48681 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NESP48681 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NESP48681 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NESP48681 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NESP48681 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NESP48681 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NESP48681 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NESP48681 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NESP48681 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NESP48681 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NESP48681 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NESP48681 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NESP48681 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms