Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms