Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms