Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms