Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBRP36941 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBRP36941 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBRP36941 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LTBRP36941 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LTBRP36941 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms