Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP6P35125 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP6P35125 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP6P35125 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP6P35125 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP6P35125 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP6P35125 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms