Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKARP32238 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCKARP32238 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKARP32238 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKARP32238 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms