Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA9P31269 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms