Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA1P29973 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms