Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
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PTPRMP28827 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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PTPRMP28827 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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PTPRMP28827 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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PTPRMP28827 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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PTPRMP28827 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
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PTPRMP28827 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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PTPRMP28827 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
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PTPRMP28827 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRMP28827 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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