Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD1P28340 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD1P28340 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD1P28340 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD1P28340 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD1P28340 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD1P28340 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD1P28340 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD1P28340 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD1P28340 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD1P28340 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD1P28340 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD1P28340 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD1P28340 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD1P28340 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD1P28340 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD1P28340 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD1P28340 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD1P28340 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD1P28340 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD1P28340 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD1P28340 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD1P28340 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD1P28340 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD1P28340 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD1P28340 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD1P28340 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD1P28340 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD1P28340 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms