Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DOBP13765 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms