Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT3P12035 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT3P12035 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT3P12035 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT3P12035 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT3P12035 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT3P12035 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRT3P12035 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT3P12035 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT3P12035 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT3P12035 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms