Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI3P10071 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI3P10071 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI3P10071 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GLI3P10071 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI3P10071 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI3P10071 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms