Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms