Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX58O95786 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX58O95786 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX58O95786 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX58O95786 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX58O95786 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX58O95786 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX58O95786 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX58O95786 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX58O95786 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX58O95786 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms