Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP2O95045 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP2O95045 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP2O95045 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP2O95045 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UPP2O95045 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms