Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms