Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSO75390 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSO75390 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSO75390 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSO75390 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSO75390 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSO75390 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSO75390 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSO75390 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSO75390 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSO75390 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSO75390 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms