Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNSO60931 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNSO60931 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNSO60931 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNSO60931 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNSO60931 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNSO60931 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNSO60931 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNSO60931 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTNSO60931 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTNSO60931 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms