Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
ABCC9O60706 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
ABCC9O60706 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms