Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPLO60437 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPLO60437 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPLO60437 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPLO60437 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPLO60437 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PPLO60437 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPLO60437 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPLO60437 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPLO60437 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPLO60437 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPLO60437 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPLO60437 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPLO60437 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms