Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms