Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms