Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNQ2O43526 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms