Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD1AO15047 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms