Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF5O00463 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms