Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIEO00221 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIEO00221 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms