Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L13C9JLJ4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms