Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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