Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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CNGA3Q16281 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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CNGA3Q16281 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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CNGA3Q16281 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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CNGA3Q16281 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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CNGA3Q16281 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CNGA3Q16281 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CNGA3Q16281 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CNGA3Q16281 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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