Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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SKIV2LQ15477 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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SKIV2LQ15477 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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SKIV2LQ15477 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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SKIV2LQ15477 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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SKIV2LQ15477 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SKIV2LQ15477 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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