Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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