Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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FOXE3Q13461 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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FOXE3Q13461 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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FOXE3Q13461 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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FOXE3Q13461 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
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FOXE3Q13461 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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