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| ADAM9 | Q13443 | AC090337.1-201 | ENST00000579651 | 2074 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | ZNF382-203 | ENST00000435416 | 3865 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | SCAI-201 | ENST00000336505 | 12079 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | LINC01247-201 | ENST00000448901 | 4209 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
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| ADAM9 | Q13443 | RNU11-4P-201 | ENST00000391149 | 133 nt | BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
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| ADAM9 | Q13443 | AC022081.1-201 | ENST00000537327 | 433 nt | TSL 2 BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC135001.1-201 | ENST00000544546 | 283 nt | BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
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| ADAM9 | Q13443 | MIR3939-201 | ENST00000582614 | 106 nt | BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC025946.2-201 | ENST00000603398 | 234 nt | BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | 7SK.7-201 | ENST00000603504 | 247 nt | BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC012409.4-201 | ENST00000612923 | 249 nt | BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC083806.3-201 | ENST00000614016 | 455 nt | BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AL713922.2-201 | ENST00000619384 | 716 nt | BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC098657.3-201 | ENST00000620434 | 263 nt | BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | PRKACB-202 | ENST00000370682 | 4288 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | LYST-201 | ENST00000389793 | 13480 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | C6orf10-209 | ENST00000612031 | 2179 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | AC027287.1-201 | ENST00000553115 | 1453 nt | BASIC | 4.43 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | ZCCHC7-202 | ENST00000336755 | 2619 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | ZNF616-201 | ENST00000330123 | 2563 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | ZNF780B-202 | ENST00000434248 | 8665 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | ZNF780B-207 | ENST00000617676 | 8664 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | NCOA1-201 | ENST00000288599 | 6952 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | Y_RNA.148-201 | ENST00000363557 | 117 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | RNU6-1284P-201 | ENST00000363701 | 100 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| ADAM9 | Q13443 | SNORD116-11-201 | ENST00000383882 | 92 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |