Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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NR1H3Q13133 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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NR1H3Q13133 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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NR1H3Q13133 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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NR1H3Q13133 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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