Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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